以正辉灯塔为目的的夜一行人终于在地图的帮忙下，走错无数大街、转错无数小巷、问了无数路人，终于是来到了正辉灯塔，而在这里还有另外两拨人，一波正是原著中的小智一行人，而另一边……
一位头系夸张的团子发，身穿印有精灵球图案的束身T恤彰显玲珑身材，下半身则选择了黑丝连裤袜搭配迷你裙的可爱美少女也朝着正辉灯塔前进，只是少女的言行有点古怪
“可恶，怎么还不到正辉灯塔啊，计算着日子也差不多了，要是在不敢过去的话，会错过和巨大快龙的见面啊”
没错，这就是我们的女主角，男主角的妹妹——芽衣
在旅行途中，芽衣渐渐没有了当初的那种稚嫩，转而是现在的成熟，因为她已经想起自己被封印的记忆了——在前世，她是一个学生，家庭美满，有疼她的父母，还有一个爱玩神奇宝贝的哥哥，不过她们的家庭是重组家庭，她和哥哥没有血缘关系，从小就笼罩在哥哥的保护下，对自己这个疼爱自己的哥哥异常喜欢，渐渐的超越了正常的兄妹之情，进化到了男女之情，她知道自己的哥哥一早就对自己有感觉，所以在她的努力下，她们兄妹两人……相爱了
在一天夜里，她走在回家的路上，路上雷电交加，一道闪电劈中她后，她昏过去了，醒来时才发现自己已经穿越到神奇宝贝的世界里，凭着前世里因为那个深爱的哥哥的缘故，所以她对神奇宝贝很是熟悉，也相当知道剧情，同样在她回忆起失落的记忆时，她的身边有这一只强大的传说神奇宝贝水都的守护神之一——拉帝亚斯，那是一只拥有流线型的身体和琉璃般的羽毛。身体的下半部为红色，长有喷气机机翼般的翅膀、鱼鳍般的足。在胸口部位有蓝色的三角形标志。
之后她从拉帝亚斯那里得知，她的哥哥也穿越了，他之后会拥有拉帝欧斯，所以她们两人从此踏上旅程,一路上也收服许多的主力神奇宝贝：妙哇花、比比鸟，紫色暴鲤龙、怪力、电龙、尼多娜，尼多利诺、六尾、呆河马、隆隆石、走路草、美纳斯
而另一边，小智一行人也来到了正辉灯塔，只是……
小智右手正拿着一支树枝，正跟着一只严重发育不良的大钳蟹对峙的情景。
“咔咔咔咔！！！”
对峙的一人一宠都开始行动起来，首先小智右手拿着树枝引诱着，让大钳蟹以为小智要拿树枝来跟自己决斗，结果把全身精力全注意在树枝身上，双钳有力的将即将要影响自己的树枝全部解决掉，待到树枝只剩下五分之一时，小智果断的丢出准备许久的精灵球。
“耶！！大钳蟹，我收服了！！”看着精灵球逐渐的停止转动，而后一声“噔”的声音逐渐暗了下去，小智的连由刚才的紧张逐渐变幻成惊喜的模样，疾步走上前将精灵球拿在手中，摆了个收服的姿势。同时心中充满得意，毕竟这可是自己不靠其他小精灵而收服的，等会看小霞和小刚怎么说。
“噗哧！！”看着小智这种搞笑的举动，刚来到海边的芽衣最终忍不住，捂嘴轻笑了起来。果然比起动画，这真人版的痴傻举动还真的另人吃惊呢。
“啊？是芽衣啊，你怎么在这里？？”听到笑声的小智连忙转过身去，望着芽衣，充满惊讶的问道。不过很快小智便把惊讶换成着急了，因为小智的精灵球忽然消失了，让小智着急的四处寻找。
“你的小精灵满6只后，第七只会自动传送到大木博士那的！”芽衣一副白痴的模样看着小智解释道：“至于我为什么在这里，因为海边可是个特训的好场所！”
“说的没错啊，芽衣”这时，一声雄厚的男声出现了，紧随而来的还有两个女孩，一个不用看就是君沙小姐，而另一位虽然不认识但是身上却散发出一股高贵的气势，一看就是出自大户人家，而她们中间站的男性更是帅气无比，没错，他们正是我们的主角，夜一行人
“小智啊，你还真是什么时候都能让我们笑起来啊，哈哈~”夜走进对众人说道
“啊，是夜，好久不见啊，你最近怎么样啊？”小智
“啊，我的无良老哥，好久不见啊，还活着呢”芽衣笑嘻嘻地对夜说道
夜的头上出现了一个大大的‘十’字
说时迟那时快，夜一把抓过芽衣，像前世那样顶妹妹的太阳穴，因为这样能让自己怀念一下自己前世的妹妹兼唯一爱过的女人，另一边芽衣也没反抗，因为这样能怀念一下前世自己唯一爱过的男人兼哥哥的爱，所以从小到大芽衣就经常惹这个哥哥生气，而哥哥也是这样来收拾她。
小智“唉，真受不了，又来了，他们兄妹俩都这样多少年了”
小霞“诶，小智，他们两个从小就这样？”
“是啊，至少从我认识他们开始就这样”
然后就是哥哥虐杀妹妹的‘残暴’场景（未满18岁的孩子请在父母陪同下观看啊~ 亲！）
然后一行人就来到了正辉灯塔
“啊，终于来到了”芽衣开心的喊道。得确，远处向这边看来距离不是很远，但是跑过来就花了很长的一段时间了，怪不得剧情中小智他们走到天黑才到了。
夜按了一下门外的铃铛，很快就传了正辉的声音了：“是谁呀？”
“正辉博士，你好，我是真新镇的夜，因为太晚了，所以想在你这里住宿一下。”夜说道。
“真新镇？夜？是大木博士说的那个夜吗？”正辉疑惑的说道
“是的，我是大木博士口中的那个夜，而且我还懂得煮饭哦”夜笑了笑道。正辉一个研究人员对于食物没有讲究的，每天差不多都是吃干粮的，食物也是一个相当大的引诱哦。
大门很快就打开了，房子里的灯立刻亮了起来，夜远远的就看见一只大大的化石盔坐在主位上面，化石盔说道：“夜，麻烦你帮我按一下这个按钮，化石盔的手太短了。”
汗，如果我们不来，那你是怎么样按下那个按钮的，嗯，应该还有后置办法吧。夜走过去按下那按钮，一个朝气蓬勃的年轻研究员正辉出现在夜他们面前。
“正辉博士，为什么躲在这个看起来很精密的布偶里面呢？”芽衣疑惑的说道。
“我认为这样可以更好的去了解神奇宝贝的想法”正辉说道。
“夜，你认为古代神奇宝贝还存在在这个世界吗？”正辉博士问道。
“我认为还存在的，他们只是沉睡在这个世界的某一个地方，而且，我曾经到过橘子群岛，芳缘地区，这些地方我都听说过古代神奇宝贝的事迹。”夜说道。
“这是真的吗？我一直都确信着古代神奇宝贝还是生存在这星球的，只是在不为人知的地方沉睡而已，夜你给我带来了新的研究动力了，我一定要继续努力的研究，谢谢你，夜”
正辉激动的说道。
怎么每一个研究员对于研究都这么的狂热，不过如果不是这样的话，也不叫研究员了。“嗯，正辉博士，如果有一天我收服到古代神奇宝贝的话，我会通知你的。”夜说道
留下了小智一行外带圣代兰芽衣陪正辉聊天后的夜直接找到厨房，做起晚餐了，走了一天的路也很累了。
“夜的厨艺实在是太好了，大木博士也跟我说过，他说你在他那学习期间，饭菜都是由你供应的，现在你出去旅行后，他又恢复吃泡面的习惯了”正辉一边吃一边说道。看来这位专业的研究人员真的是长期吃干粮或者泡面了。
夜也趁这个机会说道：“正辉博士，我打算在你这里住上一段时间，你看可以吗？”
“嗯，这是最好不过了，这段时间也可以与夜你讨论一下神奇宝贝的研究，而且还有美味的食物，夜你想住多久都没有问题，我这里没有什么人，但是房子却是很多的。”正辉说道。
夜一行人就这样在这个灯塔上住了下来，第二天，夜早早的起床，把早餐都准备后，带着神奇宝贝来到了海滩上，把神奇宝贝们都放了出来说道：“大伙们，我们一起欣赏这海上的日出吧！”
不知不觉，太阳出来了，而夜也没注意到一道美丽的身影出现在身后，夜严肃地对身边的伙伴说道：“各位，你们过几天将会遇到一个从我们相遇以来最强的敌人”众神奇宝贝听闻后眼中燃起熊熊斗志，而一旁的听的奇怪，不知为何，觉得此时的夜很是陌生，可是当听到夜接下来的话，她彻底震惊了
“过几天，你们将会遇到一只巨大的快龙，那只快龙的实力相当强悍，我想也只有水君能和它一战，所以你们要努力”
大家原本听到主人说只有水君有一战的话都显的不屑，可是当看到主人的眼神时，它们也惊讶了，主人的眼神里充满了严肃，隐约有一丝恐惧，从来没有敌人能让主人感到恐惧的，即使是一丝也是一样，它们现在都明白了——这个敌人非常强大，不是用语言可以形容的
而一旁的芽衣则是诧异，不明白为什么哥哥会知道几天后会有巨大快龙出现，难道哥哥能未卜先知？
带着这个疑惑，芽衣回到自己的房间，准备在睡一觉，因为现在还早，大家都还没起来，等回到房间后，她却不知道，这正是她的开始，命运的齿轮开始转动，因为这位妹妹不小心的偷听，原本不会有太大交集的两人的命运将会再次纠缠在一起！
“咔嚓！”