战役虽以德军占领克里特岛而宣告结束，但参战的德军空降兵阵亡失踪总数占到其三分之一。这成了希特勒一直以来“低成本”取胜的战役中的一个败笔，因此克里特岛战役的成功并不值得炫耀。甚至被希特勒称：“克里特岛之战，证明了伞兵的全盛时代已经成了明日黄花。”
1941年5月20日上午，德国发动代号为“水星行动”空的军事行动，以减少在戒备森严的克里特岛上入侵的敌军数量。在德国伞兵用空军空士兵对英国克里特岛阵地进行密集突袭后，他们空降在马莱马、莱西梅农、伊拉克利翁和查纳市机场地区，遭到顽强抵抗，遭受重大损失。在入侵的头几个小时里，发生了巨大的伤亡，第三营一个连的126名伞兵中有112人丧生。在战斗的第一天结束之前，全营600名士兵中的400人被杀。
然而，在德军的战斗中，地面部队没有任何增援，只能依靠空的力量。尽管训练有素的王牌伞兵遭受了重大损失，但他们仍以不屈不挠的战斗意志投入了激烈的战斗。战斗的第一天，德国军队投入了大量伞兵，却没有以高昂的价格达到任何战略目标。直到第二天，由于盟军的通讯问题，盟军指挥官无法及时跟踪局势，导致岛西部的马拉美机场落入德国人手中，德国人得以派遣大量增援部队空在数量上压倒盟军，最终完全控制了克里特岛。还值得一提的是，在战争过程中，德国军队首次遭遇当地平民的大规模抵抗，但德国伞兵也给予了严厉的报复。
在克里特空德国军队被打死，失踪约4 000人，受伤2 100多人，损失220架飞机，其中119架是运输机和大量船只。英国损失了15，000多人，其中1742人丧生。
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